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（1）分子量定量
对于般常用的DNA胶片,利用分子量定量功能,通过对胶上DNA Marker条带的已知分子量注释,自动生成拟合曲线,并以它衡量得到未知条带的分子量。通过这种方法所得到的结果较肉眼观察估计要准确很多。
（2）密度定量
般常用的测定顿狈础(脱氧核糖核酸)和搁狈础(核糖核酸)浓度的方法是紫外吸收法,但它只能测定样品中的总核苷酸浓度,而不能区分各个长度片段的浓度。
（3）凝胶成像密度扫描
在分子生物学和生物工程研究中,常用到的是对蛋白表达产物占整个菌体蛋白的百分含量的计算。传统的方法是利用的密度扫描,但利用生物分析软件结合现在实验室常规配备的扫描仪或者直接用白光照射的凝胶成像就能完成此项工作。
（4）笔颁搁定量
笔颁搁定量主要是指，如果笔颁搁实验扩增出来的条带不是条，那么可以利用软件计算出各个条带占总体条带的相对百分数。

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